Α. Πεζογραφία:

1. Πάπισσα Ιωάννα (1866)

2. Ιστορία ενός σκύλου (1893)

3. Ιστορία μιας γάτας (1893)

4. Ιστορία ενός αλόγου (1894)

5. Ψυχολογία Συριανού συζύγου (1894)

6. Η μηλιά (1895)

7. Το παράπονο ενός νεκροθάπτου (1895)

8. Μονόλογος Ευαίσθητου (1896)

9. Συριανά διηγήματα (μετά το 1890)

Β. Μελέτες – διάφορα:

1. Περί συγχρόνου ελληνικής ποιήσεως (1877)

2. Εθνική Βιβλιοθήκη (1880)

3. Πάρεργα (1885)

4. Είδωλα (1893)

5. Θρησκευτικοϊστορικαί μελέται (1935)

6. Άπαντα - 7τομη έκδοση (1911-1914)

7. Άπαντα - 4τομη έκδοση (1940)

8. Εμμανουήλ Ροϊδης (1952)

9. Άπαντα - 2τομη έκδοση (1955)

Γ. Μεταφράσεις:

1. Οδοιπορικό (του Σατωβριάνδου) (1860)

2. Ιστορία της Αγγλίας - 7τομη (του Μακώλεϋ) (1898 - 1902)

3. Ποιήματα του Εντγκαρ Αλαν Πόε

4. Ιστορία της Αγγλικής λογοτεχνίας (του Ταιν)